生物污染是反渗透膜系统运行中常见且严重的污染之一。一旦生物膜形成，它将成为一个自我支撑的复杂结构，吸收水中的有机和无机杂质，为下一代细胞提供营养，成为一个活的有机体。生物膜结构复杂，每个细胞支撑着整个膜生物，包括死亡细胞，也是下一代细胞的营养。此时，生物膜系统产水量降低，操作压力升高，脱盐率降低，将严重导致“望远镜”现象和机械损坏。因此，反渗透杀菌剂在有效抑制细菌生长的同时，它还可以快速杀死细菌，并将这些死细菌从膜表面清除。
反渗透膜杀菌剂包括氧化型杀菌剂和非氧化型杀菌剂。氧化型杀菌剂常用于反渗透预处理，但氧化型杀菌剂具有氧化性，对反渗透膜有一定的影响。反渗透膜进水水质中的余氯一般要求小于0.1ppm。因此，在反渗透系统中添加氧化型杀菌剂时，必须采用活性炭吸附法和亚硫酸氢钠吸附法。注意杀菌剂的连续投加。由于反渗透膜材料不耐余氯，因此在进入反渗透系统之前必须减少氧化性杀菌剂。将考虑非氧化性杀菌剂的成本。一般来说，持续剂量约为5ppm。
目前，随着反渗透膜（ 1、氧化杀菌剂
①高效广谱，杀菌灭藻速度快，杀灭效果广谱。
②治疗成本低，对环境污染的相对影响小，微生物不易产生耐药性。
③主要用于反渗透前的预处理阶段。
2、非氧化杀菌剂
①抗冲击杀菌剂用于膜系统的微生物控制，以防止细菌污染。
②它具有高效、广谱、快速的特殊效果。
③可连续添加、间歇使用或与清洗剂一起使用。
④主要用于膜保护，在设备停机时保护膜系统。
⑤主要作用于预处理阶段，直接作用于膜阶段。
冲击投加杀菌剂时，氧化型杀菌剂主要用于预处理过滤器的反洗或强化清洗和化学清洗。根据水体的生物污染程度和膜组件手册中提供的材料的耐氯性，综合考虑投加频率和剂量，达到更好的维护效果。非氧化杀菌剂可在膜系统的任何点脉冲，也可用于循环化学清洗。剂量可根据系统的实际生物污染情况选择。一些制药厂将配置反渗透膜专用杀菌剂。它能穿透微生物细胞，分解和破坏微生物细胞组织，杀死和抑制微生物细胞。对细菌形成的粘液有一定的剥离作用，与所有膜相容。它适用于较宽的pH范围，具有良好的生物降解性，对环境无污染。
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