水流经压力容器中各膜元件形成的阻力（压力损失）所产生的应力作用在每一个膜元件上，并由最末一个膜元件承受上游的元件所形成的总压降所产生的应力，因此最末元件承受应力最大。
在流量正常下，压差的上升通常是由于膜元件水流通道的隔网进入杂质，污染物质和水垢引起的，同时伴随着产品水流量下降。
当超过膜厂家建议的给水流量时，也会发生过大的压差;当起动时给水压力提升过快，发生水锤压差会很大，如膜上已有污染的垢污时，特别是由微生物污染时压差都将增大。
在系统中的空气被冲出之前进行起动，则对膜元件的水力冲击（水锤）也会发生。
高压差的防止：
1.5微米过滤器旁路。5微米过滤器应保护反渗透系统。
2.防止预处理过滤器中的过滤介质漏过。
3.泵叶轮损坏，多级离心泵如果使用的塑料叶轮，叶轮安装偏离轴心，会被磨损掉下的切削片也会造成前端膜元件的阻塞。
4.水垢可能造成末端膜元件的阻塞，应予以化学清洗并控制回收率
5.微生物污染会与反渗透系统前后压差增大同时发生，应采取生物控制和清洗，杀菌处理
6.阻垢剂沉淀
7.给水/浓水密封损坏可能造成部分给水，浓水绕过膜元件而减少了膜元件内的流速。
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