为了保证反渗透装置长期正常运行，给水预处理是极其重要的，预处理越完善，化学清洗的次数就越少，但是无论预处理多么完善，在长期运行过程中，水中存在的各种污染物总会在膜表面上积累，从而使装置的进出口压差上升，产水量减少，同时脱盐率也下降，为此，除日常启、停反渗透装置前后进行低压反冲洗外，还需进行定期化学清洗。
A.清洗条件：
1）、正常压力下，淡水流量降低了额定流量的10%-15%；
2）、为保证温度不变时产水流量恒定，给水压力增加10%-15%；
3）、产水质量降低了10%-15%，盐透过率增加了10%-15%；
4）、某段的压降明显增加；
（以上几条均在相同操作条件下比较，每次清洗后重新设定初始值）
5）、装置连续运行3-4个月时；
6）、装置需长期停运，用甲醛溶液保护前。
出现上述六种情况之一时，就应进行化学清洗。
B、膜污染物随水源的不同有很大的差别，积累的污染物通常有胶体、混合胶体、金属氧化物、微溶盐和细菌残骸等的一种或几种，在对膜进行清洗前，最好是对膜表面的污染进行实验室分析，如无此条件，则应根据装置性能下降的特征，对污染物进行初步判断，选择相应的配方和清洗工艺。
清洗时将清洗溶液以低压大流量在膜的高压侧循环，此时膜元件仍装在压力容器内而且需要用专门的清洗装置来完成该工作。
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